Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01788 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01788 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01788 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01788 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01788 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01788 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01788 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01788 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01788 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01788 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01788 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01788 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01788 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01788 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01788 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01788 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01788 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01788 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01788 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01788 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01788 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01788 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01788 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01788 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01788 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01788 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01788 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01788 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01788 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01788 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01788 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01788 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01788 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01788 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P01788 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01788 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01788 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01788 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01788 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01788 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms