Protein–RNA interactions for Protein: P01757

Ig heavy chain V region J558, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01757 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01757 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01757 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01757 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01757 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01757 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01757 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01757 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01757 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01757 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01757 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01757 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01757 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01757 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01757 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01757 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01757 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01757 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01757 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01757 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01757 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01757 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01757 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01757 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01757 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01757 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01757 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01757 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01757 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01757 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01757 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01757 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01757 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01757 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01757 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01757 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01757 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms