Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01748 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01748 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01748 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01748 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01748 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01748 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01748 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01748 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01748 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01748 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01748 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01748 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01748 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01748 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01748 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01748 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01748 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01748 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01748 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01748 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01748 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01748 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01748 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01748 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01748 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01748 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01748 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01748 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01748 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01748 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01748 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01748 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01748 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01748 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01748 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01748 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01748 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01748 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01748 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01748 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01748 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01748 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01748 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01748 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01748 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01748 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01748 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01748 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01748 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01748 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01748 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01748 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01748 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01748 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01748 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01748 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01748 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01748 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01748 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01748 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01748 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01748 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01748 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01748 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01748 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01748 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01748 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01748 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01748 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01748 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01748 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01748 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01748 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01748 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms