Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ifna1P01572 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ifna1P01572 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifna1P01572 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms