Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4bP01029 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C4bP01029 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4bP01029 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4bP01029 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4bP01029 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C4bP01029 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4bP01029 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4bP01029 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4bP01029 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4bP01029 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4bP01029 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C4bP01029 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
C4bP01029 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4bP01029 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4bP01029 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4bP01029 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C4bP01029 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
C4bP01029 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
C4bP01029 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4bP01029 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4bP01029 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4bP01029 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C4bP01029 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4bP01029 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4bP01029 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4bP01029 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C4bP01029 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4bP01029 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4bP01029 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C4bP01029 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4bP01029 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4bP01029 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4bP01029 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4bP01029 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4bP01029 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
C4bP01029 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C4bP01029 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4bP01029 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4bP01029 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4bP01029 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4bP01029 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C4bP01029 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C4bP01029 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C4bP01029 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4bP01029 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4bP01029 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4bP01029 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C4bP01029 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4bP01029 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4bP01029 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4bP01029 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4bP01029 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4bP01029 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4bP01029 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C4bP01029 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4bP01029 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C4bP01029 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C4bP01029 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4bP01029 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C4bP01029 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C4bP01029 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C4bP01029 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C4bP01029 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C4bP01029 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4bP01029 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
C4bP01029 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4bP01029 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4bP01029 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C4bP01029 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4bP01029 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4bP01029 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
C4bP01029 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C4bP01029 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4bP01029 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4bP01029 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4bP01029 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C4bP01029 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C4bP01029 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C4bP01029 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C4bP01029 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C4bP01029 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C4bP01029 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C4bP01029 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C4bP01029 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C4bP01029 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C4bP01029 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C4bP01029 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C4bP01029 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C4bP01029 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C4bP01029 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
C4bP01029 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C4bP01029 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C4bP01029 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C4bP01029 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C4bP01029 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C4bP01029 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
C4bP01029 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
C4bP01029 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
C4bP01029 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms