Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccl20O89093 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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Ccl20O89093 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccl20O89093 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccl20O89093 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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