Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp1O89090 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sp1O89090 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sp1O89090 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sp1O89090 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp1O89090 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp1O89090 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sp1O89090 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp1O89090 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp1O89090 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp1O89090 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp1O89090 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sp1O89090 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms