Protein–RNA interactions for Protein: O89033

Cdc6, Cell division control protein 6 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc6O89033 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc6O89033 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdc6O89033 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc6O89033 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms