Protein–RNA interactions for Protein: O88888

Apba3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba3O88888 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba3O88888 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba3O88888 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba3O88888 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apba3O88888 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba3O88888 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba3O88888 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apba3O88888 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba3O88888 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba3O88888 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apba3O88888 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms