Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
F11rO88792 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
F11rO88792 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
F11rO88792 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F11rO88792 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F11rO88792 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
F11rO88792 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F11rO88792 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
F11rO88792 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F11rO88792 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
F11rO88792 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F11rO88792 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F11rO88792 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F11rO88792 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F11rO88792 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F11rO88792 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F11rO88792 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F11rO88792 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F11rO88792 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F11rO88792 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F11rO88792 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
F11rO88792 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F11rO88792 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F11rO88792 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
F11rO88792 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F11rO88792 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F11rO88792 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F11rO88792 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
F11rO88792 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F11rO88792 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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F11rO88792 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.05■□□□□ -0
F11rO88792 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F11rO88792 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
F11rO88792 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
F11rO88792 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F11rO88792 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
F11rO88792 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F11rO88792 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F11rO88792 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F11rO88792 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
F11rO88792 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F11rO88792 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F11rO88792 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F11rO88792 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F11rO88792 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
F11rO88792 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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F11rO88792 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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F11rO88792 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
F11rO88792 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
F11rO88792 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F11rO88792 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
F11rO88792 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F11rO88792 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F11rO88792 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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F11rO88792 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
F11rO88792 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F11rO88792 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F11rO88792 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F11rO88792 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
F11rO88792 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F11rO88792 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F11rO88792 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F11rO88792 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F11rO88792 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F11rO88792 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F11rO88792 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F11rO88792 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F11rO88792 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
F11rO88792 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
F11rO88792 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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