Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hcn2O88703 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hcn2O88703 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hcn2O88703 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms