Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema3fO88632 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sema3fO88632 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sema3fO88632 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema3fO88632 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms