Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cops6O88545 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cops6O88545 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cops6O88545 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cops6O88545 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cops6O88545 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops6O88545 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops6O88545 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cops6O88545 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cops6O88545 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cops6O88545 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cops6O88545 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cops6O88545 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops6O88545 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cops6O88545 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cops6O88545 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cops6O88545 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms