Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dll3O88516 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dll3O88516 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dll3O88516 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dll3O88516 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dll3O88516 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms