Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dync1i1O88485 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dync1i1O88485 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dync1i1O88485 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms