Protein–RNA interactions for Protein: O88398

Avil, Advillin, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AvilO88398 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AvilO88398 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AvilO88398 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
AvilO88398 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AvilO88398 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AvilO88398 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AvilO88398 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AvilO88398 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AvilO88398 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AvilO88398 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AvilO88398 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AvilO88398 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AvilO88398 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AvilO88398 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AvilO88398 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AvilO88398 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AvilO88398 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AvilO88398 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AvilO88398 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AvilO88398 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AvilO88398 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AvilO88398 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AvilO88398 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AvilO88398 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AvilO88398 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AvilO88398 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AvilO88398 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AvilO88398 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AvilO88398 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AvilO88398 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AvilO88398 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AvilO88398 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AvilO88398 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AvilO88398 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AvilO88398 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AvilO88398 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AvilO88398 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AvilO88398 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AvilO88398 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AvilO88398 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AvilO88398 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AvilO88398 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AvilO88398 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AvilO88398 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AvilO88398 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AvilO88398 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AvilO88398 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AvilO88398 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AvilO88398 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AvilO88398 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AvilO88398 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AvilO88398 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
AvilO88398 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
AvilO88398 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AvilO88398 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AvilO88398 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AvilO88398 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AvilO88398 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
AvilO88398 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AvilO88398 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AvilO88398 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AvilO88398 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AvilO88398 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
AvilO88398 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
AvilO88398 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
AvilO88398 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AvilO88398 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
AvilO88398 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms