Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a4O88343 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc4a4O88343 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms