Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnnal1O88327 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctnnal1O88327 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ctnnal1O88327 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms