Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm10509O88255 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Gm10509O88255 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm10509O88255 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm10509O88255 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm10509O88255 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm10509O88255 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gm10509O88255 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm10509O88255 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm10509O88255 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm10509O88255 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm10509O88255 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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