Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly86O88188 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly86O88188 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ly86O88188 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly86O88188 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly86O88188 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ly86O88188 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly86O88188 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly86O88188 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly86O88188 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly86O88188 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly86O88188 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ly86O88188 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms