Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SfnO70456 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SfnO70456 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SfnO70456 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SfnO70456 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfnO70456 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfnO70456 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfnO70456 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfnO70456 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfnO70456 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfnO70456 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfnO70456 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfnO70456 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfnO70456 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SfnO70456 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SfnO70456 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SfnO70456 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SfnO70456 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SfnO70456 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SfnO70456 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SfnO70456 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SfnO70456 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SfnO70456 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SfnO70456 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SfnO70456 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SfnO70456 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SfnO70456 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SfnO70456 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SfnO70456 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SfnO70456 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SfnO70456 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SfnO70456 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SfnO70456 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SfnO70456 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SfnO70456 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SfnO70456 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SfnO70456 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SfnO70456 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SfnO70456 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SfnO70456 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SfnO70456 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SfnO70456 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SfnO70456 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SfnO70456 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SfnO70456 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SfnO70456 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SfnO70456 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SfnO70456 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SfnO70456 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SfnO70456 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SfnO70456 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SfnO70456 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SfnO70456 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SfnO70456 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SfnO70456 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SfnO70456 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SfnO70456 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SfnO70456 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SfnO70456 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SfnO70456 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SfnO70456 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SfnO70456 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SfnO70456 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SfnO70456 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SfnO70456 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SfnO70456 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SfnO70456 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SfnO70456 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SfnO70456 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SfnO70456 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SfnO70456 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SfnO70456 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfnO70456 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfnO70456 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfnO70456 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfnO70456 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfnO70456 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfnO70456 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfnO70456 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfnO70456 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfnO70456 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SfnO70456 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SfnO70456 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SfnO70456 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfnO70456 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfnO70456 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfnO70456 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SfnO70456 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfnO70456 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfnO70456 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfnO70456 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfnO70456 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfnO70456 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfnO70456 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfnO70456 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfnO70456 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SfnO70456 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SfnO70456 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SfnO70456 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SfnO70456 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms