Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gfi1bO70237 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1bO70237 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1bO70237 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms