Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Psmb5O55234 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb5O55234 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms