Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChkbO55229 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ChkbO55229 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChkbO55229 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkbO55229 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkbO55229 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChkbO55229 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChkbO55229 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChkbO55229 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChkbO55229 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms