Protein–RNA interactions for Protein: O55222

Ilk, Integrin-linked protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IlkO55222 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IlkO55222 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IlkO55222 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IlkO55222 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IlkO55222 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
IlkO55222 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IlkO55222 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
IlkO55222 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IlkO55222 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IlkO55222 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
IlkO55222 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IlkO55222 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IlkO55222 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IlkO55222 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
IlkO55222 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
IlkO55222 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
IlkO55222 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
IlkO55222 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IlkO55222 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IlkO55222 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IlkO55222 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IlkO55222 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IlkO55222 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IlkO55222 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IlkO55222 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IlkO55222 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IlkO55222 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IlkO55222 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IlkO55222 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IlkO55222 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IlkO55222 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IlkO55222 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IlkO55222 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IlkO55222 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IlkO55222 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IlkO55222 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IlkO55222 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IlkO55222 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IlkO55222 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IlkO55222 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IlkO55222 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IlkO55222 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IlkO55222 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IlkO55222 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IlkO55222 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IlkO55222 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IlkO55222 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IlkO55222 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IlkO55222 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IlkO55222 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IlkO55222 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IlkO55222 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IlkO55222 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IlkO55222 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IlkO55222 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IlkO55222 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IlkO55222 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IlkO55222 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IlkO55222 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IlkO55222 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IlkO55222 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IlkO55222 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IlkO55222 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IlkO55222 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IlkO55222 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IlkO55222 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IlkO55222 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IlkO55222 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IlkO55222 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms