Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rpl35aO55142 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl35aO55142 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl35aO55142 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms