Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyp26a1O55127 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyp26a1O55127 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp26a1O55127 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms