Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Syngr1O55100 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syngr1O55100 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syngr1O55100 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms