Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ptpn20O55082 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ptpn20O55082 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ptpn20O55082 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms