Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cacna1bO55017 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Cacna1bO55017 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cacna1bO55017 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms