Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom1O54990 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom1O54990 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom1O54990 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom1O54990 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom1O54990 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prom1O54990 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom1O54990 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom1O54990 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Prom1O54990 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms