Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Itgb3O54890 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb3O54890 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb3O54890 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms