Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DffaO54786 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DffaO54786 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DffaO54786 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DffaO54786 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DffaO54786 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DffaO54786 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DffaO54786 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DffaO54786 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DffaO54786 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DffaO54786 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DffaO54786 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DffaO54786 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DffaO54786 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DffaO54786 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DffaO54786 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DffaO54786 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DffaO54786 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DffaO54786 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DffaO54786 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DffaO54786 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DffaO54786 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DffaO54786 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DffaO54786 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DffaO54786 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DffaO54786 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DffaO54786 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DffaO54786 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DffaO54786 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DffaO54786 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DffaO54786 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DffaO54786 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DffaO54786 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DffaO54786 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DffaO54786 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DffaO54786 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DffaO54786 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DffaO54786 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DffaO54786 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DffaO54786 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DffaO54786 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DffaO54786 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffaO54786 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffaO54786 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffaO54786 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffaO54786 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffaO54786 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffaO54786 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DffaO54786 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DffaO54786 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DffaO54786 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DffaO54786 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DffaO54786 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DffaO54786 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DffaO54786 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DffaO54786 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DffaO54786 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DffaO54786 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DffaO54786 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DffaO54786 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DffaO54786 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DffaO54786 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DffaO54786 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DffaO54786 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DffaO54786 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DffaO54786 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DffaO54786 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms