Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccr6O54689 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccr6O54689 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms