Protein–RNA interactions for Protein: O35973

Per1, Period circadian protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per1O35973 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Per1O35973 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Per1O35973 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Per1O35973 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Per1O35973 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Per1O35973 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Per1O35973 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Per1O35973 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Per1O35973 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Per1O35973 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Per1O35973 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per1O35973 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per1O35973 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per1O35973 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per1O35973 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per1O35973 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per1O35973 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per1O35973 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per1O35973 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Per1O35973 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Per1O35973 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Per1O35973 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Per1O35973 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Per1O35973 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per1O35973 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per1O35973 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per1O35973 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per1O35973 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Per1O35973 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Per1O35973 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Per1O35973 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Per1O35973 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Per1O35973 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Per1O35973 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Per1O35973 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Per1O35973 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Per1O35973 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Per1O35973 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Per1O35973 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Per1O35973 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Per1O35973 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Per1O35973 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Per1O35973 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Per1O35973 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Per1O35973 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Per1O35973 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Per1O35973 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Per1O35973 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Per1O35973 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Per1O35973 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Per1O35973 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Per1O35973 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Per1O35973 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Per1O35973 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Per1O35973 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Per1O35973 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Per1O35973 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Per1O35973 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per1O35973 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per1O35973 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per1O35973 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per1O35973 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per1O35973 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per1O35973 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per1O35973 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Per1O35973 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Per1O35973 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Per1O35973 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Per1O35973 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms