Protein–RNA interactions for Protein: O35945

Aldh1a7, Aldehyde dehydrogenase, cytosolic 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a7O35945 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aldh1a7O35945 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Aldh1a7O35945 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Aldh1a7O35945 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms