Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdk5r2O35926 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdk5r2O35926 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms