Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops5O35864 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cops5O35864 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cops5O35864 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops5O35864 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cops5O35864 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cops5O35864 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops5O35864 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops5O35864 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cops5O35864 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops5O35864 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops5O35864 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cops5O35864 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cops5O35864 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms