Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf12O35738 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf12O35738 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf12O35738 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf12O35738 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klf12O35738 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf12O35738 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klf12O35738 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms