Protein–RNA interactions for Protein: O35704

Sptlc1, Serine palmitoyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc1O35704 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sptlc1O35704 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sptlc1O35704 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sptlc1O35704 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sptlc1O35704 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms