Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NudcO35685 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NudcO35685 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NudcO35685 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NudcO35685 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NudcO35685 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NudcO35685 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NudcO35685 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NudcO35685 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NudcO35685 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NudcO35685 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NudcO35685 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NudcO35685 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NudcO35685 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NudcO35685 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NudcO35685 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NudcO35685 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NudcO35685 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NudcO35685 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NudcO35685 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NudcO35685 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NudcO35685 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NudcO35685 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NudcO35685 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NudcO35685 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NudcO35685 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NudcO35685 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NudcO35685 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NudcO35685 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NudcO35685 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NudcO35685 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NudcO35685 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NudcO35685 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NudcO35685 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NudcO35685 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NudcO35685 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NudcO35685 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NudcO35685 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NudcO35685 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NudcO35685 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NudcO35685 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NudcO35685 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NudcO35685 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NudcO35685 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NudcO35685 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NudcO35685 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NudcO35685 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NudcO35685 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NudcO35685 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NudcO35685 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NudcO35685 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NudcO35685 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NudcO35685 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NudcO35685 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NudcO35685 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NudcO35685 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NudcO35685 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NudcO35685 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NudcO35685 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NudcO35685 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NudcO35685 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NudcO35685 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NudcO35685 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NudcO35685 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NudcO35685 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NudcO35685 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NudcO35685 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NudcO35685 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NudcO35685 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NudcO35685 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NudcO35685 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NudcO35685 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NudcO35685 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NudcO35685 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NudcO35685 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NudcO35685 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NudcO35685 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NudcO35685 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NudcO35685 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NudcO35685 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NudcO35685 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NudcO35685 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NudcO35685 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NudcO35685 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NudcO35685 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NudcO35685 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NudcO35685 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NudcO35685 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NudcO35685 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NudcO35685 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms