Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pold2O35654 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pold2O35654 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pold2O35654 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pold2O35654 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pold2O35654 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pold2O35654 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold2O35654 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold2O35654 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold2O35654 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold2O35654 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pold2O35654 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pold2O35654 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold2O35654 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pold2O35654 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pold2O35654 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pold2O35654 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pold2O35654 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pold2O35654 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pold2O35654 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pold2O35654 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pold2O35654 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pold2O35654 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pold2O35654 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pold2O35654 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pold2O35654 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pold2O35654 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pold2O35654 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pold2O35654 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pold2O35654 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pold2O35654 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pold2O35654 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold2O35654 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pold2O35654 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold2O35654 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold2O35654 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold2O35654 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Pold2O35654 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold2O35654 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pold2O35654 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms