Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn6O35646 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn6O35646 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn6O35646 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn6O35646 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Capn6O35646 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn6O35646 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn6O35646 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn6O35646 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Capn6O35646 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capn6O35646 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn6O35646 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capn6O35646 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms