Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clk2O35491 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk2O35491 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clk2O35491 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk2O35491 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk2O35491 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clk2O35491 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk2O35491 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk2O35491 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk2O35491 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clk2O35491 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk2O35491 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clk2O35491 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms