Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc27a2O35488 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Slc27a2O35488 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Slc27a2O35488 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms