Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clcn6O35454 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Clcn6O35454 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clcn6O35454 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms