Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Abcc1O35379 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Abcc1O35379 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Abcc1O35379 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Abcc1O35379 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms