Protein–RNA interactions for Protein: O35218

Cpsf2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf2O35218 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cpsf2O35218 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cpsf2O35218 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpsf2O35218 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpsf2O35218 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms