Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CenpaO35216 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CenpaO35216 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CenpaO35216 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CenpaO35216 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms