Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pitx3O35160 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pitx3O35160 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms